ด้านการบริหารงานงบประมาณ มีภาระหน้าที่ 21 อย่างด้วยกันคือ
- การจัดทำแผนปฏิบัติการใช้จ่ายเงินตามที่ได้รับจัดสรรฯ
- การอนุมัติการใช้จ่ายงบประมาณที่ได้รับจัดสรร
- การขอโอนและการขอเปลี่ยนแปลงงบประมาณ
- การายงานผลการเบิกจ่ายงบประมาณ
- การตรวจสอบติดตามและรายงานการใช้งบประมาณ
- การตรวจสอบติดตามและรายงานการใช้ผลผลิตจากงบประมาณ
- การระดมทรัพยากรและการลงทุนเพื่อการศึกษา
- การปฏิบัติการอื่นใดเกี่ยวกับกองทุนเพื่อการศึกษา
- การบรี้หารจัดการทรัพยากรเพื่อการศึกษา
- การกำหนดรูปแบรายการ หรือคุณลักษณะเฉพาะของครุภัณฑ์ฯ
- การพัฒนาระบบข้อมูลและสารสนเทศเพื่อการจัดทำและจัดหาพัสดุ
- การควบคุมดูแล บำรุงรักษาและจำหน่ายพัสดุ
- การจัดหาผลประโยชน์จากทรัพย์สิน
- การรับเงิน การเก็บรักษาเงิน และการจ่ายเงิน
- การจัดทำรายงานทางการเงินและงบการเงิน
- การจัดทำหรือจัดหาแบบพิมพ์บัญชี ทะเบียน และรายงาน
- การจัดหาพัสดุ
- การวางแผนพัสดุ
- การจัดทำบัญชีการเงิน
- การนำเงินส่งคลัง
- การเบิกเงินจากคลัง